Директорот раководи со работата на Агенцијата, одговорен е за законитото работење на Агенцијата и ги врши следните работи:

• Ја застапува и претставува Агенцијата,
• Потпишува договори во име на Агенцијата,
• Донесува одлуки по прашања за кои не одлучува Комисијата,
• Го предлага Статутот, Годишниот извештај за работа и Годишната програма за работа на Агенцијата,
• Дава овластувања во рамките на своите надлежности,
• Донесува решенија по прашања од надлежност на Агенцијата,
• Дава овластувања на раководни и стручни лица за вршење надзор,
• Се грижи за спроведување на подзаконски и други акти кои ги донесува Комисијата,
• Врши и други работи утврдени со Законот за поштенски услуги. 

Мандатот на Директорот е 5 (пет)  години со можност за уште еден последователен мандат.

Од 16 јануари 2024 година, Директор на Агенцијата за пошти е проф. д-р.  Сретен Миладиноски, доктор по Економски науки од Скопје.

проф. д-р.  Сретен Миладиноски  е избран Директор на Агенцијата за пошти од јануари 2024 година.